从1到8数说国家基因库

2019-09-23 13:45:44  阅读:449 来源:

国家基因库三周年

2019年9月22日

是深圳国家基因库的第3个生日

从2011年获批组成

2016年正式发动运转

到2019年运营三周年

8年淬炼

国家基因库

已铸造成生物科技探究的坚实后台

从1到8,八个数字

刚好也是它的最佳诠释

我国第

1座国家级归纳性基因库

深圳国家基因库(简称“国库”,https://gb.org),是我国第1座国家级归纳性基因库,完结从0到1的跨过,担起铸造我国生命科技战略新高地的重担。

许多人曾赞赏国库桃源般的景色,但这儿最雄壮的丘壑,藏在梯田式的修建之内——数以千万计的生物遗传资源、全球抢先的技能设备、前沿弄潮的科研工作者,以及依托这个渠道展开的科学探究。

在基因科技、精准医学、人工智能等高新技能带来的宽广远景下,在田园诗与科技梦的磕碰之中,国库打开怀有,饯别任务,力求以它的“1”,敞开千万种或许。

2大支撑:左手科研,右手工业

作为服务于国家战略的科研及工业根底设备,国库的任务,就是根据对生物遗传资源的保藏、开发和运用,为科研与工业的展开架起渠道、运送动力。

大渠道聚合大资源、大数据,广泛、高效地支撑各类项目展开,推进新效果持续产出,助力精准医疗、未来农业、海洋开发、微生物运用等谋福民生。

迄今为止,国库支撑的项目达600余个,其间不乏世界级、国家级及省级严重科研项目。

在科研方面,支撑全球科研机构展开引领性研讨,如数字化地球、数字化农业、万种植物基因组计划、酵母基因组人工组成项目、大型天然人群行列演示研讨等。

在工业方面,加速从资源搜集、根底科研到技能转化运用的周期,支撑我国低温冷冻业、高精仪器制造业、大数据等医疗及生命科学上下游工业链的快速展开;一起,活跃参与世界、国内规范的拟定,引领职业规范有序展开。

3

大功用:存、读、写

对科研、工业的大规划、多维度、全周期支撑,得益于国家基因库“存、读、写”的功用“闭环”。这一一起的功用架构,开世界之先河,三者的贯穿联动、齐头并进,更使国库走上世界前列。

生命的“存”,是指基因、细胞甚至生命个别的什物存储、生物信息的存储;

生命的“读”,是指从生命孕育到消亡,从基因组学的DNA分子到蛋白组学、代谢组学、印象组学,从结构到功用全过程、全方位和全周期的体系解读;

生命的“写”,是指通过基因、蛋白、细胞、器官、共生体系等层面的干涉技能,完结生命从“读”到“写”的跨过,通过推进生命科学与生物技能展开,促进“生物经济”在全球规划从概念走向战略的改动。

在这儿,生物遗传资源的全生命周期档案被获取、弥补、收拾、剖析和运用,这些“档案”不仅是生命的备份,也正在发明更大的价值并改动未来。

4大特性:公益、敞开、支撑、引领

在国家的支撑下,作为「存、读、写」功用的依托,国库建造了具有公益性、敞开性、支撑性、引领性的战略性科技渠道——“三库两渠道”。

这“四性”,意味着从学术界到工业圈,都可凭借国库的资源推进本身的科学研讨和技能开发,也表达了国库为我国在全球生命科学范畴的引领位置供给有力柱石、为我国生物技能和生命经济展开供给有力支撑的决计和决计。

5大分支:三库两渠道

高通量、低本钱、自动化,具有千万级的可溯源样本存储才能、杰出的样本存储和处理才能、信息化全流程的样本办理体系,归纳实力快速、均衡展开。

具有超大规划数据的存储、核算与剖析才能,并树立了国家基因库生命大数据渠道(CNGBdb),完结了样本与数据资源的整合贯穿同享。

集资源和数据于一体的可繁衍资料资源库,转化、保存的生物物种资源具有可扩增和繁衍的才能,可以无限或许地促进生物资源的合理运用和有用同享。

集自动化、信息化、高效、低本钱于一体,数据产出才能全球抢先,以国产化的先进仪器、全面的技能与运用才能,支撑各类科研、民生项目。

在高规范的科学道德与质量安全辅导下树立而成,是国内首个模块化、自动化DNA组成渠道,功率高、本钱低,到达全球抢先水平。

6大数据服务

三库两渠道的数据、资源和设备,外部单位和人员怎样获取和运用?

国库为此树立了完善的敞开同享机制——「生命大数据渠道」(CNGBdb)和「公共服务渠道」。

由生物信息数据库打造的「生命大数据渠道」(CNGBdb,https://db.cngb.org),是国内最大的生物大数据中心之一,聚集国库本身及全球其他重要数据源的揭露数据,整合各类运用东西,面向全球科研工作者推出六大数据服务:

01 数据资源检索、下载与请求

亿级索引、TB级元数据可供检索,包括文献、基因、拼装、变异、蛋白、序列、项目、样本、试验九大类。

02 样本资源检索与请求

同享数十万份动物、植物、微生物样本资源,包括血液、DNA、RNA、种子、菌株等多种类型,可请求运用、寻求协作。

03 科研数据归档

项目、样本、试验/测序、拼装、变异等各类数据,可快速递交到核酸序列归档体系(CNSA)。紧密的隐私和安全维护体系可以充沛保证数据安全。

04 数据剖析核算

供给BLAST、癌症大数据剖析、病原判定、种质性状猜测等高功用核算东西,便利对数据进行比对剖析、核算发掘。

05 科学数据库检索与剖析

根据严重项目效果建成的十大科学数据库,别离聚集植物、鸟类、鱼类、微生物组、癌症、免疫、病原、稀有病、我国人基因组,供给各类检索、剖析、比较、可视化和判定东西。

06 支撑科学文章宣布

将数据归档到CNGBdb,可以支撑科研效果宣布。到现在,支撑宣布的文章已达数十篇,被Cell、Nature子刊、NAR等多家世界威望期刊引证。

7大公共渠道服务

通过「公共服务渠道」,国库面向政府、科研单位、高等院校、医疗机构、生物企业等,敞开本身强壮的科研根底设备:

01 数字化渠道有偿运用

租借数字化渠道,运用它全球抢先的数据产出和样本处理才能,取得高通量、高质量、低本钱的数字化服务。

02 生物样本第三方存储

将生物样本托付给生物样本资源库,由自动化的多温层存储体系和全流程、信息化的样本办理体系进行办理,保证资源安全和运用价值最大化。

03 高通量核酸提取

运用生物样本资源库高通量、自动化的核酸提取与检测渠道,取得灵敏、安稳、高效的核酸提取服务。

04 生物资源供给及服务

从动植物资源活体库,请求运用微生物菌种、植物种子/分子资料和动物细胞系,或对生物资料进行存储、处理、检测和判定。

05 DNA组成

快速、精确、高质量的oligo、基因及基因组组成,非组成与修改渠道莫属,通量高、本钱低,并且是国内极少数在基因组水平的定制化规划组成服务方面有丰厚成功经历的对外服务性渠道。

06 样本库建造计划

在科学合理的样本库规划方面,国库的实战经历值得学习。从顶层规划到建造规划,从技能道路到人员培训,生物样本资源库都能供给专业、个性化的辅导和咨询服务。

07 样本库全流程信息化办理

“全人群办理与资源搜集体系”、“样本办理体系”、“样本制备体系”,这套让生物样本资源库完结全流程信息化办理的软件体系,正协助更多样本库完结办理水平的提高。

8年建造:5年磨剑,3年履责

2011-2019,国家基因库阅历5年准备、3年正式运营,用8年非凡年月,写下一部鸿篇的序章。

于三周年之际,国库和旗下各渠道的“掌舵人”一起回忆来路,展望出息:

王韧

国家基因库主任

深圳国家基因库树立三年,取得了开端的展开,从基因的存读写建成的三库两渠道功用架构,到支撑基因科技职业的展开已初见成效。现在的效果,离不开国家发改委和深圳市政府及各个理事单位的大力支撑,一起也离不开华大各位职工的尽力。可是基因库依然处于生长和转型期,未来期望深圳国家基因库可以更好的发挥敞开性和支撑性,为国家生命科技工业的展开及粤港澳大湾区建造发挥重要作用。

梅永红

国家基因库首任主任

三年还仅仅开端,我更等待10年、20年后基因库的形状:矗立在生命科学之巅的灯塔,光耀华夏,福及全球。

王博

国家基因库履行副主任

生命“存、读、写”大渠道支撑,高效安稳安全;敞开同享共有共为,负重致远,咱们一直在路上。

张二春

国家基因库副主任

通过三年时刻,咱们已开端完结基因库的“三库两渠道”建造,并树立了完善的准则流程和办理体系,尤其是打造了一支优异的人才团队。现在基因库各项首要功用指标现已处于世界前列,未来在咱们一起尽力下,信任咱们会取得更大的成果。

钱璞毅

生物样本资源库主管

咱们现已完结了千万级高质量、可溯源的生物资源样本存储才能,研讨拟定了生物样本收集、贮存和办理的相关规范和技能规范。未来咱们将进一步扩展存储规划,敞开全球科研协作,打造特征资源库,支撑服务于我国大民生、大科学、大工业项目。

曾文君

生物信息数据库主管

以CNGBdb生命大数据渠道为根底,咱们构建了业界抢先的高功用生物信息剖析渠道,为全球科研机构和科学家供给了交融“搜、存、算、用”一体化的高效、安全的科学数据服务。新的一年,咱们将持续秉承着“不忘初心,砥砺前行”的信仰,助力我国生命科技科研和工业蓬勃展开。

危金普

动植物资源活体库主管(代)

咱们转化和保存生物物种可繁衍体,形成了集基因数据和活体资源为一体的数字化资源库,为生命科学研讨和生物工业立异展开供给可持续的资源保证。

卢浩荣

数字化渠道主管

根据团队在基因数字化和试验室运营的经历,依托华大智造自主测序仪,咱们建造了一个集自动化、信息化、高效低本钱于一体的“读”渠道,并在通量、本钱、功率等方面全球抢先。着眼未来,咱们将不断提高测序才能,持续保持在范畴内的世界竞争力和影响力,充沛发挥渠道的引领性、支撑性、敞开性和公益性,助力生命科学和生命经济展开。

沈玥

组成与修改渠道主管

基因组组成与修改技能已成为现代生命科学的重要共性根底技能,其打破将是组成生物学、基因修改甚至生命科学及相关运用范畴展开的重要转折点。曩昔三年咱们开端完结了大规划高通量组成修改才能的建造,取得国内外协作单位的高度认可,未来咱们会持续尽力前行,促进”存读写“闭环的工业运用转化,一起支撑科学研讨和工业运用展开。

陈振家

公共服务部主管

呼应国家大型科研根底设备向社会敞开的召唤,咱们探究了基因库对外协作的新模式,以非盈利为准则,统筹本钱补偿和渠道可持续展开,支撑服务了国内外数十家科研机构。未来咱们将持续供给专业的渠道支撑服务,促进我国生物工业的持续立异,推进生命经济高质量展开。

万仟

宣扬协作部主管

国家基因库通过多年的展开和堆集,逐步被越来越多的业界同仁和群众了解和认可,已开端树立了掩盖全球的协作网络以及面向群众的科普交流渠道。咱们将以愈加活跃的心态,同各行各业的同仁展开协作,在生命科学范畴一起打造敞开协作的生态圈。

李启沅

质量安全与规范部主管

咱们树立和完善了以“三标”为中心的质量办理体系,逐步完善以安全法律法规、GB/T33000、ISO27001等为根底的安全办理体系,发布施行29项规范,完结以存读写、大贯穿为根底的规范引领。愿基因库在新的起点,迈上新征途,开立异光辉;在质量优先、安全保证、规范引领下完结共有、共为、同享的愿景。

1st国家级归纳性基因库

2大支撑

3大功用

4大特性

5大分支

6大数据服务

7大公共渠道服务

8年建造

其实,要界说国家基因库,比以上这些数字更为恰当的方法,或许是用它的远景和未来。这个界说,将由时刻执笔,在生命科学的巨大地图之上,持续书写。

下一个三年,等待国库持续聚合资源、敞开同享、支撑科研、赋能工业,见证和助力生命科学的不断腾跃。

End

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